上海2021年3月10日 /美通社/ -- 近日,領(lǐng)星生物接受《上海信息化》雜志專訪,基于其開發(fā)的臨床智能分析平臺(tái),探討了人工智能系統(tǒng)和數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)算法相結(jié)合的新型商業(yè)模式,在助力腫瘤藥物創(chuàng)新研發(fā)中的重要意義。以下是專訪原文:
從真實(shí)世界診療數(shù)據(jù)來看,有很大一部分癌癥患者無法在現(xiàn)有的治療體系中獲益,因此急需打破傳統(tǒng)制藥和治療手段,尋求臨床應(yīng)用新思路。
近年來,行業(yè)逐漸開始探索從藥物機(jī)制相關(guān)性入手深度挖掘真實(shí)世界臨床數(shù)據(jù),探索更為有效的藥物或聯(lián)用方案,以期提升患者的生存率。
傳統(tǒng)制藥遇挑戰(zhàn)
惡性腫瘤是危害人類健康的重大疾病。腫瘤免疫治療能夠調(diào)控自身的免疫系統(tǒng),有效清除惡性腫瘤細(xì)胞。多種腫瘤免疫治療策略為腫瘤治療帶來希望,其中腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療被廣泛關(guān)注,尤其是針對(duì)特定患者的個(gè)體化治療日益受到重視。
但目前專門針對(duì)抗癌創(chuàng)新藥物的研發(fā)還是大多采取傳統(tǒng)的制藥思路,即從腫瘤生物學(xué)分子機(jī)制的通路開始研究,分析生物功能及在細(xì)胞中的作用。隨后,再把這個(gè)功能映射到臨床試驗(yàn),檢驗(yàn)在臨床端是否能像預(yù)想的一樣起到類似作用。在不斷的嘗試過程中,傳統(tǒng)方法的弊端逐漸顯現(xiàn)出來:從實(shí)驗(yàn)室走向臨床的過程中,臨床端可能會(huì)顯現(xiàn)出與前期研究成果完全不同的結(jié)論。
在腫瘤創(chuàng)新藥物研制過程中,傳統(tǒng)制藥思路更是頻頻受阻。由于腫瘤受到周圍組織、血管、人體免疫系統(tǒng)等影響,單個(gè)細(xì)胞在理想環(huán)境下的生長(zhǎng)條件與人體的復(fù)雜環(huán)境截然不同,因此往往在患者體內(nèi)實(shí)現(xiàn)不了實(shí)驗(yàn)中的良好抑制效果和作用。
由此可見,難以預(yù)測(cè)的臨床轉(zhuǎn)化,成為創(chuàng)新藥研發(fā)的重大難題。在信息化高度應(yīng)用的當(dāng)今時(shí)代,制藥信息化、智能化成為必然趨勢(shì)。隨著腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療的日臻推進(jìn),廣泛縱向的臨床數(shù)據(jù)正在與全面的分子基因數(shù)據(jù)深度融合,促進(jìn)著腫瘤診療的前移,加速腫瘤藥物的研發(fā)與商業(yè)化。其中,領(lǐng)星生物科技(上海)有限公司(以下簡(jiǎn)稱“領(lǐng)星生物”)開發(fā)的臨床智能分析平臺(tái)(Clinical Intelligence Analysis Platform,簡(jiǎn)稱CIAP),創(chuàng)新使用“全面基因”+“深度臨床”的全景數(shù)據(jù),人工智能系統(tǒng)和數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)算法相結(jié)合的新型商業(yè)模式,在助力腫瘤藥物創(chuàng)新研發(fā)的過程中發(fā)揮著巨大潛能,為癌癥轉(zhuǎn)化研究和腫瘤藥物臨床開發(fā)提供強(qiáng)有力的數(shù)據(jù)解決方案。
領(lǐng)星運(yùn)用臨床患者真實(shí)療效開始的反向轉(zhuǎn)化策略,為后續(xù)的臨床開發(fā)不僅規(guī)避了從模型到人體,再從個(gè)體患者到群體患者的臨床轉(zhuǎn)化中的巨大的不確定性風(fēng)險(xiǎn),而且還提供了明確的獲益患者人群和分子標(biāo)記物,概念上就是直接精準(zhǔn)針對(duì)未滿足的臨床需求。
數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)算法
通過臨床藥物精準(zhǔn)開發(fā)智能化相關(guān)技術(shù)和平臺(tái)的研發(fā),可以實(shí)現(xiàn)藥物研發(fā)從臨床開始的反向轉(zhuǎn)化。在過去3年多時(shí)間,領(lǐng)星生物致力于幫助中國腫瘤患者在臨床端通過精準(zhǔn)治療的手段做針對(duì)性、個(gè)體化的診斷和治療。在治療手段和終身隨訪基礎(chǔ)上,領(lǐng)星生物積累了大量中國腫瘤患者分子、臨床方面的數(shù)據(jù)。通過這些分子和臨床大數(shù)據(jù),以及企業(yè)自主研發(fā)的人工智能算法,可以分析出臨床的相似性表現(xiàn),推演出相似患者共同的分子機(jī)制,從而探索更好的治療方式。基于此思路,已經(jīng)上市的藥物可以尋找更合適的人群;新藥探索階段,研發(fā)人員能根據(jù)臨床的數(shù)據(jù)支持,尋找新的靶點(diǎn),由此大大提升制藥企業(yè)工作效率。
反向轉(zhuǎn)化的背后,需要數(shù)據(jù)和算法的支持。
數(shù)據(jù)方面,領(lǐng)星生物采用具有CLIA/CAP(Clinical Laboratory Improvement Amendments,臨床檢驗(yàn)改進(jìn)修正計(jì)劃/ College of American Pathologists,美國病理學(xué)家協(xié)會(huì))認(rèn)證的國際標(biāo)準(zhǔn)的第三方檢驗(yàn)所來進(jìn)行終端患者數(shù)據(jù)的采集。目前已經(jīng)積累的臨床分子數(shù)據(jù),在領(lǐng)星生物的系統(tǒng)里,可以為藥物研發(fā)企業(yè)提供一整套分析整合后的解決方案。
算法方面,領(lǐng)星生物研發(fā)了數(shù)據(jù)智能技術(shù)。整合國際標(biāo)準(zhǔn)的CLIA /CAP臨床實(shí)驗(yàn)室服務(wù)、大型真實(shí)世界的深度分子臨床整合數(shù)據(jù)(全面的基因組學(xué)+臨床病史+長(zhǎng)期生存數(shù)據(jù)集)、云端開放交互式SaaS(Software-as-a-Service,軟件即服務(wù))系統(tǒng)、以及獨(dú)有的數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)智能算法,能夠幫助客戶高效實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的全部潛能。該算法,可將臨床分子關(guān)系和治療方案從10的12次方的海量數(shù)據(jù)中挖掘出獨(dú)立的有用信息。
基于自有數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)算法,領(lǐng)星生物提出并優(yōu)化臨床假設(shè),最大程度實(shí)現(xiàn)真實(shí)世界與臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)和知識(shí)的潛力,同時(shí)基于廣泛臨床醫(yī)療網(wǎng)絡(luò)的前瞻性和回顧性研究,以直接富集目標(biāo)患者群體,驗(yàn)證臨床假設(shè)。針對(duì)未滿足的腫瘤臨床需求,在藥物機(jī)制引導(dǎo)下,全面系統(tǒng)、多維度的適應(yīng)癥和適用人群拓展,通過在真實(shí)世界大數(shù)據(jù)中對(duì)相關(guān)藥物在多維度細(xì)分人群中的臨床結(jié)局比較,支持制定靈活的市場(chǎng)推廣策略。
藥物研發(fā)的未來機(jī)遇
臨床智能分析平臺(tái)將精準(zhǔn)醫(yī)療的測(cè)序定位為全外顯子組檢測(cè)+RNA 檢測(cè),外顯子組為所有基因中所有編碼蛋白質(zhì)組的DNA 部分,覆蓋24000多個(gè)與疾病相關(guān)的基因,而基因Panel (一組或一套檢測(cè))是指被選擇的若干個(gè)基因。
領(lǐng)星生物在對(duì)腫瘤患者的樣本進(jìn)行測(cè)序后,會(huì)上傳到云上以分析變異,同時(shí)通過自建的腫瘤用藥數(shù)據(jù)庫,自動(dòng)生成結(jié)果報(bào)告。從獲取腫瘤患者的臨床樣本到給到醫(yī)生臨床用藥指導(dǎo)的報(bào)告,整體服務(wù)交付周期可在不到一周內(nèi)完成。通過領(lǐng)星生物的臨床智能分析平臺(tái),患者可以更快地獲得更全面的用藥指導(dǎo)信息。
此外,領(lǐng)星生物數(shù)據(jù)智能服務(wù)的功能已在新型生物標(biāo)志物/新藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、作用機(jī)制探索、臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)和預(yù)測(cè)、藥物聯(lián)合策略、精準(zhǔn)患者分層,以及藥物新適應(yīng)癥擴(kuò)展等方面得到了初步印證。2020年3月試運(yùn)行以來,領(lǐng)星生物已經(jīng)與10多家公司簽訂合作協(xié)議,達(dá)成相關(guān)業(yè)務(wù)的深度合作。合作雙方借力各自在知識(shí)驅(qū)動(dòng)(knowledge-driven)和數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)(data-driven)藥物開發(fā)領(lǐng)域的豐富經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行深度整合,從臨床藥物高效開發(fā)和真實(shí)世界明確獲益的結(jié)合角度,以終為始地催生現(xiàn)有創(chuàng)新藥物的新適應(yīng)癥及其聯(lián)合方案的優(yōu)選開發(fā)和布局體系,共同推動(dòng)臨床藥物精準(zhǔn)開發(fā)的智能化進(jìn)程。
在實(shí)際應(yīng)用中,臨床智能分析平臺(tái)顯現(xiàn)出了多項(xiàng)優(yōu)勢(shì):
臨床智能分析平臺(tái)的研發(fā)和使用,是跨學(xué)科應(yīng)用的產(chǎn)物,生物信息學(xué)、臨床腫瘤學(xué)、基因組學(xué)、臨床制藥、軟件架構(gòu)、人工智能/機(jī)器學(xué)習(xí)和云計(jì)算等領(lǐng)域的綜合專業(yè)知識(shí)的融合運(yùn)用,才能夠使平臺(tái)為腫瘤新藥研發(fā)提供科學(xué)系統(tǒng)的解決方案。
創(chuàng)新是藥物開發(fā)未來的發(fā)展方向和挑戰(zhàn),“數(shù)據(jù)+智能”是藥物研發(fā)的未來機(jī)遇。領(lǐng)星生物等新一代藥物研發(fā)企業(yè)將在醫(yī)藥數(shù)據(jù)智能領(lǐng)域進(jìn)行深耕,助力抗腫瘤新藥研發(fā),為中國乃至世界的腫瘤患者帶來福祉。
*本文轉(zhuǎn)載自《上海信息化》雜志,期刊號(hào)為:徐慧娜,智能分析平臺(tái)助力腫瘤新藥研發(fā),上海信息化.[J]2021.(1):48-50.