深圳2021年12月3日 /美通社/ -- 近日，國際人類蛋白質組計劃確定，由承啟生物承接國際人類蛋白質組計劃的官方數(shù)據庫neXtProt（亞洲分站）的建設。這是國際人類蛋白質組計劃第一次將官方數(shù)據庫交由亞洲公司進行建設，標志著中國在人類蛋白質組計劃中的核心地位提升，也顯示出承啟生物不僅僅在測序領域取得國際聲譽，同時在蛋白質組學領域也受到國際學術界的權威認可。11月底，承啟與neXtProt數(shù)據庫工作人員進行視頻連線會議，neXtProt亞洲分站的建設正式開始。
承啟團隊與neXtProt工作人員視頻連線會議
國際人類蛋白質組計劃（Human Proteome Project, HPP）是國際人類基因組計劃（Human Genome Project, HGP）的后續(xù)國際合作項目，最早可追溯至2000年。彼時，人類基因組計劃尚未完成，科學家們就已經意識到搞清楚人類基因組并不能完全理解人的生理病理過程，因為一個基因可以變化出幾種至數(shù)千種不同的蛋白質形體(proteoform)，而蛋白質才是各種生理和病理功能的實際執(zhí)行者。因此，各國科學家又策劃了人類蛋白質組計劃，力圖研究所有的人類蛋白質，這樣才能解開生命的奧秘。經過12年的前期準備，2012年人類蛋白質組計劃正式啟動。
人類蛋白質組計劃的官方數(shù)據庫是neXtProt (www.nextprot.org)，目的是建立一個人類蛋白質的百科全書。這個龐大的數(shù)據庫最初由瑞士生物信息學研究所(Swiss Institute of Bioinformatics) 和GeneBio SA 共同開發(fā)，不但存儲了大量的人類蛋白質知識庫，也有大量蛋白質組、微陣列、RNA、蛋白質相互作用、蛋白質-小分子相互作用等高質量數(shù)據集，其上的數(shù)據頻繁地更新，是人類蛋白質研究的集大成者，相當于研究人類蛋白質的基礎設施。
neXtProt數(shù)據庫網站界面
隨著人類蛋白質研究的不斷深入，neXtProt數(shù)據庫的容量越來越大，服務器負荷日漸沉重。中國日益增長的科研實力使得中國學者訪問該數(shù)據庫的需求與日俱增，但現(xiàn)有數(shù)據庫的資源卻遠遠不能滿足要求。為了推動人類科學界對人類蛋白質組的研究，尋找有實力、有口碑的單位進行合作就成為其最佳選擇。最終，承啟被選定為neXtProt亞洲分站的承建單位。
雖然承啟的主營業(yè)務主要是與大規(guī)模測序相關，由于其自研的FANSe系列高精度測序比對算法而被業(yè)界熟知，但承啟在蛋白質組上的積累很早就開始了。早在2014年，承啟首席科學家張弓教授所建立的翻譯組測序技術就被作為人類蛋白質組計劃的核心支柱之一，并連續(xù)被HUPO（人類蛋白質組組織）邀請在HUPO大會上做演講。2017年，承啟在HUPO大會上宣布免費為人類蛋白質組計劃提供翻譯組測序服務。2018年，承啟發(fā)布了當時世界上最強的翻譯組學數(shù)據庫，為蛋白質組研究提供了重要的參考，該數(shù)據庫被發(fā)表在國際權威期刊Nucleic Acids Research上。2019年，張弓教授發(fā)表重大成果，通過翻譯組測序技術發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個原本認為不可能編碼蛋白質的“非編碼基因”實際上能翻譯出50個氨基酸以上的蛋白質，并且這些蛋白質穩(wěn)定存在，在癌癥中發(fā)揮著重要作用，人類基因組需要被系統(tǒng)性地重新注釋。承啟在這一研究中提供了核心的生物信息學分析服務。因此承啟被委以此重任，絕非偶然。
對承啟而言，常年具備處理海量組學數(shù)據的能力，可以完全承擔建立neXtProt所需的服務器資源和技術資源，因此neXtProt亞洲分站的建設和運維都將由承啟負責。
承啟承建人類蛋白質組計劃官方數(shù)據庫neXtProt的亞洲分站，標志著中國在人類蛋白質組計劃中的核心地位提升，這是承啟為推動人類蛋白質組計劃進展、為中國和亞洲的蛋白質科學發(fā)展的又一貢獻。
