廣州2021年12月7日 /美通社/ -- 12月1日,基準(zhǔn)醫(yī)療與南開(kāi)大學(xué)聯(lián)合共建的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)研究中心提交的重量級(jí)學(xué)術(shù)論文《Noninvasive Lung Cancer Early Detection via Deep Methylation Representation Learning》被人工智能促進(jìn)協(xié)會(huì)AAAI(Association for the Advancement of Artificial Intelligence)下屬的全球人工智能頂級(jí)學(xué)術(shù)會(huì)議,第36屆AAAI'22(會(huì)議時(shí)間:2022年2月22日-3月1日,溫哥華)收錄。本次會(huì)議共收到9251篇投稿,創(chuàng)下AAAI投稿量的歷史紀(jì)錄;最終接收1349篇論文,錄取率為15.0%,創(chuàng)歷史新低。
基準(zhǔn)醫(yī)療基于AI深度學(xué)習(xí)(Deep Learning)的DeepMeth甲基化數(shù)據(jù)處理模型是全球首個(gè)基于深度學(xué)習(xí)的通過(guò)連續(xù)向量表示甲基化區(qū)域的算法,也是基準(zhǔn)醫(yī)療肺癌早檢產(chǎn)品PulmoSeekTM Plus的核心算法基礎(chǔ)。此次基準(zhǔn)醫(yī)療DeepMeth研究工作能從近萬(wàn)份研究論文中脫穎而出,是世界AI學(xué)術(shù)界對(duì)基準(zhǔn)醫(yī)療在腫瘤早診早篩領(lǐng)域的工作的高度認(rèn)可,也是精準(zhǔn)醫(yī)療及AI+癌癥交叉學(xué)科領(lǐng)域的一個(gè)令人振奮的消息,再加上早前PulmoSeekTM肺癌早檢甲基化液體活檢模型已在國(guó)際重要學(xué)術(shù)期刊《The Journal of Clinical Investigation》發(fā)表,多項(xiàng)國(guó)際學(xué)術(shù)權(quán)威機(jī)構(gòu)的認(rèn)可奠定了基準(zhǔn)醫(yī)療在全球肺癌早檢領(lǐng)域當(dāng)之無(wú)愧的技術(shù)領(lǐng)先地位。
請(qǐng)參照下文對(duì)這項(xiàng)算法的解讀:
突圍之路,破局ctDNA甲基化早檢臨床應(yīng)用瓶頸
血漿樣本中低豐度的循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)一直是癌癥早檢的難點(diǎn)。南開(kāi)大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院與基準(zhǔn)醫(yī)療的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)研究中心聯(lián)合攻關(guān),歷經(jīng)數(shù)年,首次利用深度學(xué)習(xí)連續(xù)向量表示甲基化區(qū)域的算法,強(qiáng)化了甲基化區(qū)域的整體性和連續(xù)性,成功開(kāi)發(fā)了“深度甲基化表示學(xué)習(xí)進(jìn)行無(wú)創(chuàng)肺癌早期檢測(cè)的DeepMeth”核心技術(shù),一舉突破這個(gè)重大的學(xué)術(shù)和產(chǎn)業(yè)難關(guān)。
精準(zhǔn)錨定,探秘CpG 位點(diǎn)的豐富遺傳學(xué)信息
不同于現(xiàn)有指標(biāo)通常僅表示每個(gè)區(qū)域甲基化位點(diǎn)的頻率、忽略甲基化CpG位點(diǎn)的定位和甲基化模式,而這些正是癌癥檢測(cè)的預(yù)測(cè)特征;DeepMeth獨(dú)立看待每個(gè)甲基化區(qū)域并開(kāi)發(fā)出自動(dòng)編碼器來(lái)學(xué)習(xí)隱藏在區(qū)域布局中的豐富信息(例如,甲基化 CpG 位點(diǎn)的位置和共甲基化區(qū)域)。這是世界上首次用連續(xù)向量表示甲基化區(qū)域的深度學(xué)習(xí)模型研究,可以很大程度上避免甲基化檢測(cè)的維度災(zāi)難。
深度驗(yàn)證,普及肺癌早檢臨床應(yīng)用
DeepMeth算法模型已在全國(guó)14家醫(yī)院多中心臨床數(shù)據(jù)集上評(píng)估了檢測(cè)性能:與基線相比,DeepMeth實(shí)現(xiàn)了顯著的AUC提升;并可與傳統(tǒng)的臨床檢查指標(biāo)相結(jié)合,提高整體檢測(cè)的準(zhǔn)確度。自2020年4月以來(lái),全國(guó)已有94家醫(yī)院使用了基于DeepMeth模型的PulmoSeekTM Plus產(chǎn)品(用于早期肺癌檢測(cè))。
基準(zhǔn)醫(yī)療始終堅(jiān)持從“衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)的角度”出發(fā),本著“以患者利益為本”的初心,在技術(shù)上精耕不輟、厚積薄發(fā),不斷優(yōu)化產(chǎn)品性能,提高性價(jià)比,將癌癥早期診斷整體解決方案落到實(shí)處,最終惠及更多有需要的普通人群。